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为确保菌群库有序、高效的运行，菌群库的整体设计布局依据医药厂房设计规范，基于菌群制备流程，菌群库设计有采样间、处理间、质检间及储存间。其中，处理间的功能区域划分为菌群提取区、菌群制备区和清洗灭菌区，配套有相应的功能辅助区。设立专人定期维护保养并持续监测洁净区环境，为维持菌群库日常运行保驾护航。